Né en 1949 à Tunis, aujourd'hui installé en Bourgogne, Bernard Lecomte a fait ses études à Paris. Il est diplômé de l'Institut national des langues et civilisations orientales, où il a étudié le russe et le polonais.
À 15 ans, il a commencé à faire des piges au journal Tintin. Devenu journaliste professionnel il a notamment été chef du service étranger à La Croix, rédacteur en chef de Médiaspouvoirs, grand reporter à L'Express (où il a couvert la fin du communisme en Europe) et rédacteur en chef du Figaro Magazine. Il intervient régulièrement dans les médias (chroniqueur sur RCF, consultant sur RTL puis sur BFM TV).
Bernard Lecomte a publié de nombreux ouvrages consacrés à la vie politique française, à l'Europe de l'Est et au Vatican. On lui doit notamment des biographies sur Jean-Paul II et Benoît XVI mais aussi des ouvrages sur le Vatican.
En 2016, Bernard Lecomte publie aux éditions Plon, « Le dictionnaire amoureux des papes ».